本发明提供一种同井多层自我注采的井下流体分离自驱井及开采方法，自驱井包括：母井，其设有互不连通的注入流道和采出流道；分支井组，包括至少一个注入井段和至少一个采出井段，至少一个储层中设有分支井组，注入流道通过注入井段与多个储层连通，采出流道通过采出井段与多个储层连通，注入井段与注入流道连通而形成注入通道，采出井段与采出流道连通而形成采出通道；井下流体分离系统，其入口与采出流道连通，第一出口与井口连通，第二出口与注入流道连通。本发明能实现井下油水、油气或气水分离，并在同井多层中自我驱替和能量补充，减轻举升能耗，减少钻井数和地面分离处理设备，节省成本，提高单井产量和采收率。