本发明提供了一种面向图形处理器的可信执行环境构建方法及系统，包括：步骤S1：根据GPU可信执行环境创建控制信息，创建GPU可信执行环境创建，获取GPU可信执行环境创建控制信息；步骤S2：根据GPU提交控制信息、GPU执行任务控制信息，进行GPU提交和执行任务，获取GPU提交和执行任务结果信息；根据GPU检查控制信息、GPU启动控制信息，进行GPU任务在可信执行环境中检查和启动，获取GPU提交和执行任务结果信息；步骤S3：获取面向图形处理器的可信执行环境构建结果信息。本发明利用IOMMU的虚拟化支持，为不同GPU进程分配不同的PASID，从而实现每个GPU可信执行环境间的内存隔离的方法。