本发明提供了一种综合能源系统的设备调度管理方法和系统，包括：获取综合能源系统各类能源设备的负荷需求量和能源供给时长的当前预测值；将所述当前预测值输入预先构建的设备调度管理数字孪生模型DT3，得到各类能源设备的能源流入量、流出量和设备容量；基于所述各类能源设备的能源流入量、流出量和设备容量，对综合能源系统各类能源设备的启停和出力进行控制；所述设备调度管理数字孪生模型DT3，是考虑综合能源系统的各种能源流之间的耦合关系、输入量约束和潮流约束以及设备运行调度成本约束而构建，本发明考虑各能源流之间的耦合关系构建，实现了综合能源系统运行过程中对各能源子系统之间的协同管理，提高了综合和能源调度管理的灵活性。