本发明涉及一种温控隔离采样台及其使用方法，属于医疗设备技术领域。本发明包括隔离间，隔离间的正面设置有风帘窗口，隔离间的内壁设置有气流腔，隔离间内设置有与气流腔连通的进风口，气流腔内设置有抽风装置以及消毒装置；采样台面，采样台面上设置有与抽风装置出口连通的出风口，出风口与风帘窗口对应设置；体温传感器，体温传感器用于采集隔离间内的患者体温信息，并将采集到的患者体温信息发送至控制处理器；控制处理器，控制处理器用于根据采集到的患者体温信息，向抽风装置发送对应的风速信号，以调节出风口的风帘风速。相对于现有技术，本发明能根据患者当前的体温变化，调节出风口的风帘风速，从而实现智能调节。