本申请涉及一种业务隔离方法、装置、SDN网络系统及路由设备，属于通信技术领域。该方法应用于SDN网络中的路由设备，方法包括：在接收到对端设备经预先建立的隧道转发的GRE封装报文时，对GRE封装报文进行解封装并获取封装于GRE头部的key字段中的key值；根据预先设置的路由标识符与key值的对应关系，查找获取的key值对应的路由标识符，并将解封装后得到的原始报文转发到与路对应的由标识符对应的业务接口。本申请实施例中，通过为不同的应用业务分配不同的VRF标签，将其绑定到应用业务对应的业务接口上，并将不同的VRF标签中的路由标识符与隧道外层封装的GRE头部中的key值做关联对应，来实现业务隔离。