本发明公开了一种电机位置数据补偿方法，对位置编码器和数据采集器之间整个数据传输链路的通讯延时而造成的位置滞后偏差进行实时位置补偿控制，包括：电机位置数据补偿装置数据采集过程的通讯接口固定时延补偿控制、以及数据采集器数据获取过程的数据采集器读取随机延时同步补偿控制。本发明可以向数据采集器发送精准的实时位置数据，满足电机控制系统高精度、高实时性的现场应用需求，采用可编程逻辑方式，易于实现控制，且不需要增加硬件设施投入，适合工程化推广应用。