本发明公开了一种果蔬套袋复合材料及其制备方法与应用，所述复合材料按质量份计，包括以下原料：成膜物质1～5份、分散剂50～90份、抗菌植物精油‑壳聚糖基微纳胶囊0.1～2份、增塑剂1～10份、纳米增强粒子1～10份、粘结剂0.5～5份。本发明采用安全高效乳化剂，抑菌谱广、抗菌性强的植物精油，壳聚糖及其衍生物，基于乳液模板法来有效构建长效缓释型微纳胶囊生物抗菌剂，并将微纳胶囊与壳聚糖及其衍生物、纳米增强粒子成膜液复配构建果蔬套袋复合材料，所得复合材料通过便捷的喷雾涂膜方式即可应用于果蔬中，且可以实现抗菌植物精油的缓慢释放，有效提高果蔬防虫抗菌保鲜效果，从而提高果蔬品质。