本发明公开了一种燃料电池双极板自动定位焊接装置，涉及燃料电池加工设备技术领域。包括焊接平台、焊接机械臂、第一极板上料平台、第二极板上料平台、第一上料机构、第二上料机构、移动机构和联动调节机构，第一上料机构和第二上料机构结构相同且均包括水平上料组件和吸附组件，第一极板上料平台和第二极板上料平台上均设有推料组件和定位组件，联动调节机构包括联动组件、传动组件和限制组件，联动组件设置在第一极板上料平台上的推料组件和移动机构之间。本发明能够提高极板运输的稳定性，防止极板在运输过程中发生脱落，自动根据极板尺寸的变化进行调节，保持极板对齐的准确性，操作简单。