本发明公开了一种PP-TPU复合薄膜及其制备方法和应用，所述高透明PP-TPU复合薄膜，包括以下质量份数的原料：聚丙烯树脂85-92份，TPU 5-10份，相容剂3-5份，成核剂1-3份；所述聚丙烯树脂、TPU、相容剂以及成核剂均为固体材料。本发明中，通过采用相容剂以及成核剂等，使得非极性的PP以及极性的TPU得以相容，解决了两者相容性差问题，为薄膜材料的配方，提供了新的思路。本发明中，通过上述配方制备的复合薄膜，机械性能好，能够降低雾度，提高透光率，扩大其应用范围。