本发明公开了一种双母线供电系统及控制方法，所述双母线供电系统包括第一负载、第二负载、第一母线L1、第二母线L2、第三母线L3、控制单元以及分别与控制单元连接的第一双向可控硅SCR1、第二双向可控硅SCR2、第三双向可控硅SCR3、第一切换开关K1和第二切换开关K2；所述第一母线L1和第二母线L2分别通过所述第三母线L3与第一负载和第二负载连接，所述第三双向可控硅SCR3将第一母线L1和第二母线L2相连；所述第一切换开关K1和第二切换开关K2分别与第三母线L3连接；本发明提供的双母线供电系统，采用SCR1、SCR2和SCR3代替传统的隔离断路器，并设置有控制单元，可避免双母线供电系统切换过程中所造成的负载短暂中断事件的发生，提高切换的稳定性和切换效率。