本发明公开了一种羟基磷灰石负载纳米零价铁复合材料及其制备和应用的方法，其制备方法采用水热合成的羟基磷灰石为载体，在吸附Fe2+数小时后，在惰性气体氛围下还原亚铁得到纳米零价铁，经洗涤离心，冷冻干燥后即得一种羟基磷灰石负载纳米零价铁复合材料。其对六价铬的去除效果最好，将高毒性的六价铬还原成低毒性的，去除率能达到100％，而且能够同时高效快速去除废水中的铜、钴、镍等二价重金属阳离子，去除率也高达98％左右。本发明可应用于废水重金属离子的去除净化，同时也能用于含多种重金属污染土壤的修复。