本发明公开了一种用于水电站发电机监控系统一次调频的方法及系统，属于电力系统技术领域。本发明方法，包括：获取一次调频使用的频率计算值；获取一次调频的频率偏差；对频率偏差进行除去死区及限幅处理，获取频率偏差信号，根据频率偏差信号获取一次调频功率；获取一次调频整功率限速有名值；根据一次调频整功率限速有名值，获取一次调频功率补偿分量；通过一次调频功率补偿分量，对水电站发电机监控系统进行一次调频。本发明将一次调频功率与其它功率指令数学叠加，使得一次调频动作过程中可以跟踪实发功率，从而不影响一次调频效果，实现一次调频与AGC协调，有效发挥机组对系统频率和功率的支撑能力。