本发明涉及图像配准领域，提出了一种亚像素图像配准方法，包括：图像预处理：将图像处理成灰度图像，并对灰度图像中的角点进行像素级识别，得到所有的初始角点；特征提取：对所述提取的初始角点进行亚像素定位；特征匹配：对所述亚像素级角点进行匹配。其中，本发明采用金字塔LK光流算法作为配准算法，解决传统匹配算法因考虑速度而在匹配点周围邻域搜索而无法处理大而不连续的运动的问题，使匹配的精度上了一个台阶，为后续图像重建提供了更为精确的偏移量。