一种基于脑机混合智能的意念控制假肢系统，包括依次连接的视觉刺激模块、便携式脑电信号采集设备、脑电信号处理与识别模块和假肢，所述视觉刺激模块用于为被试者提供视觉刺激选项，脑电信号处理与识别模块用于采集被试者的SSMVEP脑电信号，脑电信号处理与识别模块用于对SSMVEP脑电信号进行特征提取和分类，根据分类结果驱动假肢进行6种动作，所述6种动作为：按电梯，竖大拇指，将水倒入杯子，将食物送入嘴中，将物体上移到橱柜，两根手指捡起一个物体。本发明能够对疲劳状态下的脑卒中患者提高分类辨识精度，进一步减少疲劳状态下脑卒中患者对假肢的误操作率，方便脑卒中患者的日常生活，提高意念控制假肢系统的适用性。