本发明涉及一种智能井隔离装置及其使用方法，包括以下步骤：在井下设置智能井系统隔离装置，所述智能井系统隔离装置包括设置在井下第一层的数字液力控制系统、设置在井下第二层的直接液力驱动系统以及与两驱动系统相连的第一～第三液力管线；通过对第二液力管线和第三液力管线反复交替单独打压，实现直接液力控制系统对井下第二层井下滑套的控制；通过对第一液力管线进行打压关闭第二层后，再向第一液力管线或第二液力管线打压，实现数字液力控制系统对井下第一层液路的控制。本发明可以广泛应用于油气钻完井和油气开采领域。