本发明公开了一种生物合成肌醇的集胞藻基因工程菌及构建方法及应用，构建为：从酿酒酵母中获得肌醇‑1‑磷酸合酶基因，与从集胞藻6803中获得的肌醇‑1‑单磷酸酶基因整合到质粒pCP3031上，构建p3031S，得到重组集胞藻6803工程菌WT‑INO1SS。以质粒pBA3031‑HM(the*)为模板，构建P0168‑ZP，转入工程菌WT‑INO1SS中，得到重组集胞藻6803工程菌WT‑INO1SSZP。实验证明，本发明的基因工程菌最终肌醇的产量21.74mg·L‑1。在集胞藻6803中成功实现了肌醇的生物合成，弥补了当前尚无蓝细菌作为底盘生产肌醇的空白。对利用光合微生物生产肌醇具有重要意义。