本发明公开了一种计算果树冠层光合速率的方法，包括以下步骤:S01：获取同一果树上冠层位置的足量叶片样本，并获取叶片样本的叶片表型特征；S02：利用计算机三维模拟技术建立若干个果树冠层的三维模型，将叶片样本的表型特征导入模型内，进行实验对照；S03：逐一分别改变若干个对照组的光合因素；S04：将记录到的氧气的释放量数据重新导入三维模型内；S05：将所有叶片样本对照组的光合速率参数数据收集，对所有的氧气释放量进行计算。本发明中，该果树冠层光合速率的方法采用三维模拟技术可以建立若干个果树冠层叶片的实验组，对果树冠层叶片的光合速率参数进行群体性的测定和仿真验证，从而确保光合速率计算数据的准确性。