本发明公开一种包装系统，包括物料整理装置及码垛转移装置，物料整理装置包括第一传送带、第二传送带及转袋机构，转袋机构设置在小袋物料从第一传送带跌落至第二传送带的路径上，转袋机构包括转袋板、转袋驱动件及转袋托板，转袋板的半个摆动周期与相邻的两个小袋物料从第一传送带掉落至第二传送带上的时间间隔对应，相邻的两个小袋物料通过转袋板的两个相对的表面导引及转袋托板的配合落在第二传送带上时袋头和袋尾的朝向相反，第二传送带将小袋物料传送至码垛工位，码垛转移装置包括支撑臂、设置于支撑臂的相对两端的码垛筐及驱动支撑臂旋转的旋转驱动件，支撑臂旋转以将两端的码垛筐于码垛工位及装袋工位之间切换。