本发明公开了一种双主动全桥变换电路的保护方法及保护电路，保护方法包括：获取每个双主动全桥变换器的变压器副边电流；判断每个变压器副边电流是否超过预设变压器副边电流阈值；当存在变压器副边电流超过预设变压器副边电流阈值时，确定对应的变压器被击穿，控制被击穿的变压器对应的断路器断开。本发明提供的双主动全桥变换电路的保护方法及保护电路，通过判断每一个副边绕组电流是否超过预设值，精确地定位具体被击穿的变压器的具体位置，快速控制对应的断路器断开，从而实现了双主动全桥变换电路故障的快速定位及隔离。