本发明公开了一种果香型酵母、筛选方法及在香烟中的应用。本发明所述的一种果香型酵母的筛选方法，包括以下步骤：(1)在不同海拔烟草种植区的多个地点，分别取样；(2)称取烟草样品，剪碎后分别放于培养基中，振荡培养，将培养液进行梯度稀释，分别涂布于平板，置于培养箱中培养，挑取生长的单菌落接种到平板；(3)将步骤(2)在平板上培养的单菌落接种于液体培养基，振荡培养；(4)采用嗅香的方式进行感官评价，香味品质越好筛选最佳的果香型酵母。R59菌株产香发酵液过滤后均匀喷洒在烟丝表面，制成卷烟后进行感官综合评价，发酵样品的果香气更浓更饱满，香气的协调性也有增加，余味更干净，能够显著提高抽吸品质。