一种焦耳级三波长可调谐单频脉冲激光器，包括种子激光器模块、振荡器、多级放大器、非线性变换模块、三波长及三波束输出切换模块；本发明可实现1064nm、532nm、355nm总能量为焦耳级的百赫兹单频脉冲输出；可用于星载高光谱激光雷达，定量获取云‑气溶胶的多参数信息；可用于星载测风激光雷达，获取3‑30km高度的全球大气风场信息；本发明主要解决了焦耳级单频脉冲放大问题、解决了单频脉冲高效倍频的问题、解决了三波长与三波束切换的问题、解决了三波长能量调谐的问题。