本发明公开一种智能点验钞机本外币纸币自动分币系统及其分币方法，具有图像采集模块和图像处理模块，图像采集模块包括CIS图像采集电路、码盘信号产生电路以及FPGA控制电路，CIS图像采集电路将采集的图像原始数据经AD转换电路送至FPGA控制电路，码盘信号产生电路采集点钞机运转时的钞位移并产生脉冲信号送至FPGA控制电路；FPGA控制电路对CIS图像采集电路传输的数据和码盘信号产生电路的信号进行处理，输出图像信号传输至图像处理模块。本发明对于不同币种、不同发行银行、不同面额、不同版别他和不同下钞方向的钞票通过统一算法区分各种本外币，无需用户手动输入所点纸币钞票信息即可自动识别出本外币纸币钞票信息。