本发明提供一种多标准安全基准的检测方法、系统及目标主机、服务器、电子设备、存储介质，涉及主机安全技术领域，该方法包括：接收目标主机上传的基准配置请求，所述基准配置请求包括基准项；对所述基准项进行处理获得脚本文件；将所述脚本文件下发至所述目标主机，由所述目标主机对所述脚本文件进行执行获得检测结果；获取所述目标主机上传的检测结果，对所述检测结果进行处理获得检测结果报告。该方法融合多种组织标准的安全基准检测系统的工具，可满足不同场景下的检测需求，不同来源的基准项统一进行存储结构建模，方便进行管理，统一的配置方式和结果输出使得基准检测配置、实施简单高效。