本发明公开了基于稀疏表示的下肢深静脉血栓溶栓疗效预测方法及系统，方法包括：从磁共振成像图像中获取下肢深静脉血栓的感兴趣区域；对下肢深静脉血栓的感兴趣区域进行影像组学特征提取，得到全局影像组学特征和稀疏表示影像组学特征；采用显著性检验法从全局影像组学特征和稀疏表示影像组学特征中筛选出具有显著差异的影像组学特征；根据具有显著差异的影像组学特征采用支持向量机的方法进行下肢深静脉血栓溶栓疗效预测。本发明结合了传统影像组学方法提取的全局影像组学特征和稀疏表示影像组学方法提取的稀疏表示影像组学特征来进行溶栓疗效预测，能涵盖更多的有效特征，通过显著性检验法减少了冗余特征，可广泛应用于医学图像处理领域。