本发明公开了一种基于方向行波的直流配电网故障选线方法、装置和系统，(1)提取电压行波信号和电流行波信号；(2)获取电压、电流行波线模分量；(3)当电压或者电流行波线模分量的微分量连续多点均大于启动判据整定值时，启动故障保护动作；(4)分解出各条直流配电线路的电压前行波、反行波；(5)处理得到各条直流配电线路的前行波、反行波故障选线判据系数；(6)将某条线路的前行波选线判据系数与其他各线路的前行波选线判据系数两两相乘，若相乘的结果均为负数，即判定该条线路发生故障，切除该线路。本发明采用方向行波的微分量作为保护判据量，能够实现故障线路的有效识别和准确判断，提高故障线路识别准确率以及故障线路的切除速度。