本发明公开了一种带变频水力模块的水冷一体式冷水机的控制方法，所述带变频水力模块的水冷一体式冷水机包括水冷冷水机组、与所述水冷冷水机组相配合的冷却塔、变频水力模块、控制器及变频器，所述水冷冷水机组包括压缩机、冷凝器、蒸发器及节流装置，所述变频水力模块包括补水阀、水过滤器、变频冷冻水泵及膨胀罐，所述蒸发器进水口设有冷冻进水温度传感器，所述蒸发器出水口设有冷冻出水温度传感器；通过对变频冷冻水泵的调节，使冷冻水流量和冷冻水泵功率据实况改变，在部分负荷下使冷冻水泵功率大幅下降，降低冷冻水泵和冷却塔的实际运行能耗占比。