本发明公开了一种基于运用效能的作战系统操作行为分析方法，将作战运用效能表现量化，确定运用效能信号；采用极限测试法确定作战系统响应函数，推算逆系统响应函数；根据作战运用效能信号和逆系统响应函数，确定总体操作信号；从总体操作信号中分离出不同属性的操作信号；将不同属性的操作信号与对应的正常操作信号比较，找出异常的属性操作及其变化值。本发明对作战系统的人员操作行为进行解析化分析，提升了分析的便捷性和准确性，能够为后续操作行为调整，提升运用效能提供更加精准的参考意见。