本发明涉及生物医学技术领域，具体是一种抗肠道病毒71型感染的新靶点及应用。本发明以人结肠癌细胞(Caco‑2)作为靶细胞，采用RNA干扰技术下调靶细胞膜受体的表达，来寻找可有效抑制EV71感染人结肠癌细胞的宿主因子，达到从源头(肠道)阻断EV71感染的目的。本发明通过实验发现成纤维细胞生长因子受体1(FGFR1)在EV71感染Caco‑2细胞中发挥着重要的作用，下调FGFR1的表达，能明显抑制EV71的感染。本发明提供了FGFR1在制备预防或治疗肠道病毒71型感染药物中的应用，为临床预防和治疗因EV71感染所导致的手足口病、脑膜炎、脑干脑炎或脊髓灰质炎等疾患提供了新的靶点和治疗方案。