本发明涉及一种基于致密储层数字岩心计算岩石渗透率的方法，包括以下步骤：(1)基于微纳米CT实验结果，建立致密储层岩心的复杂数字岩心，其中包括：岩石骨架、孔隙空间和微纳孔系统；(2)基于所建立的数字岩心，利用灰色格子Boltzmann方法模拟流体的流动；(3)流动方向的边界条件为循环边界，并且外加作用力，其他方向为封闭边界条件；(4)根据计算的流速和压力结果，结合量纲分析，得到岩石的渗透率。本发明利用灰色格子Boltzmann方法，在传统算法的基础上，综合考虑了微纳米孔隙的流动，高效准确地实现了岩石渗透率的求取，方法新颖、可推广性高。