本发明公开一种基于计算机视觉的猴脸亲缘关系分析方法，包括基于手工标记的猴脸图像，运用Faster R‑CNN模型训练猴脸检测器；基于猴脸检测器获取猴脸坐标并保存猴脸图像，结合已有的猴子身份，种群信息，建立一个猴脸图像数据库；设计猴脸亲缘关系验证算法，通过对深度卷积神经网络的训练对猴脸分析目标特征进行猴脸亲缘关系分析。本发明方法应用卷积神经网络挖掘利用更多猴脸信息来达到更准确的亲缘关系分析，对测试样本和训练样本之间的相关性无要求，当猴脸姿势、尺度发生较大变化时，仍然能准确判断。