本发明提供一种带数据采集卡的测风雷达系统及其工作方法，该系统包括多个信号采集模组以及计算机，每一信号采集模组包括种子光源，种子光源向声光调制器输出种子激光信号并经过声光调制器调制后输出至激光放大器，激光放大器将调制信号放大后输出至光学望远镜；每一数据采集卡包括模数转换电路，用于将接收到的模拟回波信号转换成数字回波信号；处理器，用于对数字回波信号进行中位值平均滤波计算后，将滤波后的数据进行离散傅里叶变换获得离散数据；无线传输模块，用于将离散数据发送至计算机；计算机接收多个数据采集卡传输的数据。该方法是上述的测风雷达系统的工作方法。本发明可以降低测风雷达的生产成本，并提高检测的准确性。