本发明公开了矿区优先流影响下的地下水溶质运移模拟系统，包括矿区优先流测定系统、溶质弥散系数计算系统和溶质运移测定系统，所述溶质运移测定系统根据矿区优先流类别特征和溶质在矿区优先流内的对流弥散系数实际测定出溶质在矿区优先流内的实际运移状态，并对实际运移状态下溶质的移动方向进行标记，得到矿区优先流影响下的地下水溶质运移情况；本发明系统通过矿区优先流测定系统对矿区优先流类别特征进行测定，得出一个具有判定精度的矿区优先流类别结果可以为地下水溶质运移模拟提供稳定的模拟基础，有效提高地下水溶质运移模拟效率，能够精确得到地下水溶质运移变化情况。