本申请提供一种环氧树脂组合物及其制备方法和应用。该环氧树脂组合物包括如下重量份的组分：100份的环氧树脂、55-90份的固化剂、0.1-0.8份的促进剂、300-420份的无机填料和4-15份的弹性体颗粒。本申请提供的环氧树脂组合物通过无机填料高填充降低了固化收缩率，降低浇注形成固化物的热膨胀系数，配合一定比例的弹性体颗粒降低了无机填料高填充对固化物的脆性影响，显著提升了材料的抗冲击强度，其抗疲劳振动和抗开裂性能增强，且不影响材料的耐高温性能，对玻璃化转变温度没有明显影响，热稳定性好，电气性能好。