本发明公开了一种广域多因子身份认证系统，包括身份认证SDK模块，用于读取身份认证终端用户信息并和身份认证服务器进行交互，对身份认证流程、网络通信、数据加解密传输进行安全封装；数字证书系统，用户人员证书等证书实体的签发和管理，支持将人员证书、安全标签导入身份认证终端和统一身份认证服务器，将设备证书、程序证书导入统一身份认证服务器；身份认证终端；和统一身份认证服务器，集中管理和维护用户信息、设备信息、业务应用信息，提供身份认证和安全审计服务；在用户身份认证和业务应用程序入网认证通过后，将认证结果返送至业务应用程序，获取登录用户及业务应用程序的访问权限。本发明灵活性和安全性更高，通过数字证书签发系统实现用户的统一授权和管理。