本发明公开了一种程序更新方法，包括预先确定出仿真系统中的控制保护设备的修改版程序与真实系统中的控制保护设备的完整版程序之间的差异页面；获取真实系统中当前的完整版程序；将差异页面覆盖于当前的完整版程序，得到更新后的修改版程序；将更新后的修改版程序应用于仿真系统。可见，通过本申请中的程序更新方法，可以实现依据最新的真实系统中的完整版程序，对仿真系统中的简化的控制保护设备中的修改版程序进行适应性更新，能够更新除差异页面之外的所有页面内的程序，有利于提高仿真系统仿真结果的准确性。本发明还公开了一种程序更新装置、设备及计算机可读存储介质，具有如上程序更新方法相同的有益效果。