本发明的目的在于提供一种封闭式微涡流澄清器及其澄清方法，其包括封闭壳体，壳体包括圆筒、与圆筒顶部密封连接的上壳体和与圆筒底部密封连接的下壳体；通过合理的结构设计将壳体内部分隔为污水第一通道、污水第二通道、污水第三通道和污水第四通道，且通道内部均填充有若干微涡流絮凝球；污水由进水管依次经进水口、污水第一通道、污水第二通道、污水第三通道、污水第四通道和出水管排出壳体。本发明体积小、结构紧凑，污水通过本发明的四个通道三次澄清阶段，其具有高效的絮凝澄清效果。