本发明公开了一种高度近交实验用小型猪封闭群的繁育方法，其包括如下步骤：A)、F0世代小型猪父本和母本交配繁育F1世代，剔除不良个体；B)、对步骤A)未被剔除的F1世代小型猪OB基因进行检测，BB基因型的小型猪淘汰，AA、AB基因型的小型猪留种；C)、对步骤B)留种的F1世代进行基因纯合度检测，符合近交系数范围和基因组纯合度范围的种公猪和种母猪留种；D)、步骤C)留种的F1世代进行同胞交配繁育F2世代，重复剔除不良个体，并重复所述步骤B)和步骤C)；E)、重复步骤D)，直至封闭群数量稳定。本发明建立了一种繁育高度近交实验用小型猪封闭群的繁育方法，选育的小型猪的近交系数高，基因纯合度高。