本申请涉及集成电路领域，公开了一种小数分频锁相环锁定检测方法及其系统。该方法包括用该压控振荡器输出的第一时钟对输入该锁相环的参考时钟进行采样后得到采样信号，其中该第一时钟频率高于该参考时钟；将该采样信号作为基准时钟，采样计算N个基准时钟周期内的该分频器的计数器的过零状态值和计数值，所述计数值是在所述N个基准时钟周期内所述第一时钟的周期个数，其中N≥1；以及根据该过零状态值和该分频器的输入分频比确定该锁相环的锁定状态。本申请实施方式中对小数锁相环锁定状态检测的检测速度快、准确率高。