本发明公开了一种E级超算海洋模式自动移植优化方法，包括：基于热点函数的特征利用建立的代码分析工具确定热点函数代码数据；利用卷积神经网络从所述热点函数代码数据中提取出热点函数特征，并对热点函数特征进行向量化处理，以获取热点函数的特征向量；将所述热点函数的特征向量输入到双向LSTM神经网络中，并在所述双向LSTM神经网络中引入自注意力机制进行训练，以根据输出的第一主从核代码数据确定最优双向LSTM神经网络模型；根据所述第一主从核代码数据利用强化学习方法进行迭代训练，以确定最优强化学习模型；对于从客户端获取的源代码数据，利用所述最优双向LSTM神经网络模型和最优强化学习模型，获取最优的主从核代码方案，以实现代码自动移植。