本发明公开了一种土壤中有机氯农药残留检测方法，其主要包括以下步骤：制备磁性硅胶微球；将有机氯类农药模板和功能单体溶于溶剂中，加入交联剂和引发剂，紫外灯照射引发聚合，甲醇冲洗，制得有机氯类分子印迹微球；利用所述有机氯类分子印迹微球作为固定相，装填层析柱，对土壤环境样品进行层析萃取；将层析液合并旋蒸后，经质谱仪进行定性和定量检测氯含量。本发明所述检测方法采用有机氯类分子印迹微球作为固定相，对土壤中的有机氯类农药残留进行富集纯化，并通过质谱仪检测，定性准确，灵敏度高。