本发明公开了一种海上岩面仿生套箱围堰及其施工方法，海上岩面仿生套箱围堰包括侧板体、内支撑、限位、斜撑、剪力钉、护裙、吨袋、锚杆、顶纵梁、吊具、钢护筒，围堰在工厂加工，在码头拼装，利用浮吊整体安装，将海上施工转为工厂施工、岸上施工，质量可控，施工便捷。海上岩面仿生套箱围堰的施工方法的具体施工步骤为：1、测量海床标高；2、围堰设计及加工；3、锚杆施工；4、围堰加工及拼装；5、围堰起吊及运输；6、围堰下放；7、封底混凝土施工；8、承台施工，最后得到海上岩面仿生套箱围堰。本发明解决了在裸岩地质、海床面起伏较大条件下采用常规围堰无法施工的难题，具有快速施工、施工操作容易、结构简单、安全可靠、无需对海床进行特殊处理等优点。