本发明公开了一种菌剂喷雾干燥保护剂及其应用。本发明使用的喷雾干燥保护剂中的主要成分为处理过的豆渣。将新鲜豆渣经过烘干、研磨与过筛后加入发酵液中混合均匀，进行喷雾干燥。本发明使用的微生物包括地衣芽孢杆菌（Bacillus licheniformis），保藏号CGMCC No.1.265；枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis），保藏号CGMCC No.13932；丁酸梭菌（Clostridium butyricum)，保藏号CGMCC No.1.5205。使用处理过的豆渣作为喷雾干燥保护剂能提高菌剂的活菌数，且豆渣的利用可以减少废弃物的排放，保护环境，变废为宝，降低成本。