本发明提供了一种嘧菌酯中间体的制备方法，所述制备方法为：由化合物A和二氯嘧啶在三甲胺催化剂存在的条件下，加入甲醇钠的甲醇溶液，或分别加入甲醇钠和甲醇，反应生成化合物B和化合物C所示的中间体混合物，本发明通过利用三甲胺催化剂催化化合物A合成嘧菌酯的中间体化合物B和化合物C，反应高效，收率高，并且三甲胺催化剂沸点低，容易回收，降低了废水中氨氮含量，废水的处理困难降低，降低处理成本。回收后的三甲胺催化剂可以重复用于中间体化合物B的制备，同样具有很高的催化效果，也能得到高的产物收率。综合成本优势显著，适合工业化生产。