本申请公开了一种光子晶体复合彩膜及其制作方法、彩色滤光基板，复合彩膜包括：光通道层，包括上下相叠的第一光子晶体层和第二光子晶体层，其包括阵列排布的光通道单元，在各光通道单元中，第一光子晶体层的光子禁带与第二光子晶体层的光子禁带不同，第一光子晶体层与第二光子晶体层的光子禁带的组合使得仅允许红光、绿光或蓝光通过光通道单元；以及量子点材料层，其设置在光通道层的一侧，包括阵列排布的红光量子点激发材料区域和绿光量子点激发材料区域，它们分别和光通道层中的红光通道单元和绿光通道单元相对应。根据本申请实施例的复合彩膜，减少了蓝色量子点材料的使用，降低成本，可显著提高彩膜的透过率。