本发明提供了一种独活种子的储藏方法，该方法为：将成熟的独活种子采收后，在阴凉通风处平铺自然晾干，筛选出千粒重为3.8g～4.8g的优质种子，将优质种子放入包装袋中，挤压排除气体后封口，然后在-15℃～4℃的温度条件下储藏。本发明独活种子的储藏间长，从不足10个月延长到2年，并且萌发率高，有利于种质资源的保存，降低了保存成本，操作简单，易于实现，独活种子可以安全储藏到春季再进行播种，避开了冬季低温，使独活种子在比较适宜的温度条件下和相对较短的时间内萌发。