本发明涉及一种维吉尼亚霉素高产菌株的高通量筛选方法，本发明公开了快速的维吉尼亚霉素检测方法，通过在检测样品中加入含有对二甲氨基苯甲醛、异丙醇和强酸的显色剂进行显色反应，根据显色产物的吸光值计算维吉尼亚霉素的产量，结合维吉尼亚霉素生产菌株的多孔板培养和高效快速的样品提取方法，实现了对维吉尼亚霉素高产菌株的高通量筛选。本发明提供的高通量筛选方法，与传统的筛选方法相比，具有快速高效、简单易行等优势，能够大大缩短筛选周期，提高菌株的筛选效率，极大地降低了维吉尼亚霉素高产菌株选育的工作量，为高产菌株的选育提供了有力的技术保障。