本发明公开了一种生物安全应急防护箱，包括防护箱体，所述防护箱体底部外表面固定连接有密封胶垫，所述防护箱体内腔通过隔离板设置为真空腔和设备腔，所述密封层内表面两侧内壁中上位置通过滑槽滑动连接有放置板，所述密封层内腔顶部位于放置板正面和背面均固定连接有抽气口，所述滑动轨道内表面滑动连接有物品放置箱，所述设备腔内腔底部位于滑动轨道两侧对称位置均固定连接有真空吸泵，所述设备腔内腔顶部中间位置固定连接有灭菌消毒装置，本发明涉及生物安全技术领域。使得该装置可有效隔离污染区域，并对其中的气体进行消毒灭菌，在真空条件下进行污染区的初步清理，避免人员直接接触，保证人身安全，同时避免空气污染。