自动化钻机集成安全保护系统及控制逻辑包括：控制器和若干控制系统，控制器用于接收司钻房内发出的控制指令，控制各个控制系统的输入和输出并切断动力源，所述的控制系统包括：绞车控制系统、顶驱控制系统、仪表系统、液压站系统、发电机系统、钻台面检测急停系统、二层台检测系统、猫道控制系统、铁钻工控制系统、自动排管控制系统、缓冲机械手系统和吊卡卡瓦系统、发电机系统；各个控制系统分别控制各单元信号的输入和输出。司钻房通过系统总急停、发电机系统急停、区域急停系统实现对整个钻机分区、分系统停车。本发明可实现设备作业和交接过程的安全性；也可以实现设备作业过程的紧急保护。