本发明公开了一种基于灵敏度分析的主动配电网电压协调控制系统及方法，包括：用于选择主动配电网系统内电压越限最大的节点的电压越限目标筛选模块；根据电压灵敏度矩阵选择最佳有功设备的FCE有功调节选择模块；根据电压灵敏度矩阵选择最佳无功设备的无功设备选择模块；用于完成有功目标值下发的FCE有功调节模块；用于完成无功目标值下发的无功调节模块；用于针对有功目标值和无功目标值对智能管理器分别进行有功PID调节与无功PID调节，并完成FCE控制的快速计算的协同交互控制器；用于对有功设备及无功设备分别进行有功目标值的设定的智能管理控制器。本发明达到主动配电网多目标协调优化控制的要求。