本发明涉及金针菇瓶栽设备技术领域，具体是一种能够对搔菌刀及栽培瓶口灭菌的搔菌装置及搔菌方法。能够对搔菌刀及栽培瓶口灭菌的搔菌装置包括机架、间歇拨瓶总成、送瓶总成、搔菌总成、瓶口灭菌总成和出瓶输送机；间歇拨瓶总成包括托盘、槽轮机构、拨瓶器和拨瓶器驱动电机；送瓶总成、搔菌总成、瓶口灭菌总成和出瓶输送机沿托盘的周向依次间隔设置；送瓶总成包括送瓶支架、辊子、阻尼轮和弹性阻尼臂；搔菌总成包括升降支架、升降气缸、翻转箕、摆动气缸、搔菌刀、搔菌刀驱动电机、搔菌刀灭菌酒精灯、老菌皮回收输送机和栽培瓶限位板；瓶口灭菌总成包括凸轮、凸轮驱动电机和瓶口灭菌酒精灯。本发明的能够对搔菌刀及栽培瓶口灭菌的搔菌装置能够自动对搔菌刀进行高温灭菌，从而防止杂菌感染。